中国船舶研究所排名前五的分别是中国船舶研究院、中国船舶研究设计中心、中国船舶科学研究中心、哈尔滨船舶锅炉涡轮机研究所、西安精密机械研究所。

1.中国船舶研究院：前身隶属国防部，现是中国船舶重工集团公司的军品技术中心、科技开发中心，主要从事舰船武器装备发展战略研究、舰船系统顶层技术研究、系统集成及系统工程管理、军民两用技术的开发研究。

2、中国船舶研究设计中心：主要承担舰船总体研究、设计、开发的任务，尤以舰船总体系统工程见长。自1961年建所以来，该所以舰船的研究与开发为己任，为保卫祖国的海疆、护航护渔、打击走私、海难救助、出国访问等方面作出了不可磨灭的贡献。

3、中国船舶科学研究中心：主要从事基础应用研究和应用技术研究，承担大中型军民船舶、海洋工程、水下物体和水中兵器的水动力学、结构力学、推进器和声隐身性能的检测、预报、优化计算机软件的研究，以及高性能船、潜器和其它海事装备的总体性能研究、设计和开发。

4、西安精密机械研究所：创建于1962年，是中国科学院在西北地区最大的研究所之一。近期所内重点学科领域为瞬态光学、空间光学、光电工程、光电子学、光子技术、信息光子学、水下光学等。