仲恺农业工程学院是二本院校。人们俗称的所谓几本，是指我国普通高等学校参与全国普通高等学校招生录取第几批次。过去，各个省市区根据历年录取情况，把全国重点高校已经多年录取分数线高招生人数多的高校列为靠前批次录取俗称一本院校，列为第二批次第三批次录取分别称为二本院校、三本院校。

在安徽省，二三批次合并为第二批次，也就是只有一本、二本院校。仲恺农业工程学院是一所以农业工程为主的普通本科高校，办学历史较长，具有硕士学位授予权，校址在广东省广州市。仲恺农业工程学院在各省市区都是参与第二批次录取，因此是二本院校。