墨尔本大学共设有12个学院（其中1个已经解散），具体情况如下：
1.设计学院（Melbourne School of Design）
2.文学院（Faculty of Arts），下设：
• 人文社科学院（Graduate School of Humanities and Social Sciences）
• ***学院（Melbourne School of Government）
3. 商业与经济学院（Faculty of Business and Economics），下设：
• 商学院（Melbourne Business School）
4. 教育学院（Melbourne Graduate School of Education）
5. 工程学院（Melbourne School of Engineering）
6. 信息学院（Melbourne School of Information）
7. 法学院（Melbourne Law School）
8. 医学、牙医与健康科学学院（Faculty of Medicine, Dentistry and Health Sciences），
下设：
• 牙医学院（Melbourne Dental School）
• 医学院（Melbourne Medical School）
• 健康科学学院（Melbourne School of Health Sciences）
• 人口与卫生学院（Melbourne School of Population and Global Health）
• 心理学院（Melbourne School of Psychological Sciences）
9. 理学院（Faculty of Science）
•　理学研究生院（Melbourne Graduate School of Science）
10.兽医与农业科学学院（Faculty of Veterinary and Agricultural Sciences）
11. 维多利亚艺术与音乐学院（Faculty of VCA and MCM）
12. 土地与环境学院（School of Land and Environment）：现已解散，其项目并入了兽医与农业科学学院、理学院之中，但作为一个项目的主体仍然存在。
墨尔本大学专业设置全面，涵盖本科、荣誉学士、硕士、博士等多个层次，为学生提供了100多种专业，比如，会计、金融、农业、建筑、商务、通讯、牙科、经济、教育、工程、环境科学、人文、生物、化学、法学、工商管理、国际商务、市场营销、电子工程、生物工程、机械工程、社会科学、医药研发、音乐舞蹈、美术、戏剧等等。多个专业排名位居全国乃至世界前50名。
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