预防接种是预防百日咳的最好方法。在小儿出生后2-3月开始，每隔4周注射一针百白破三联疫苗，连续3次。一年后首次进行强化注射，4-6岁再进行第二次强化注射。

对没有进行过预防接种的体弱宝宝，如已接触过百日咳的患病宝宝，可注射丙种球蛋白，以增强机体的防御机能。对以前已经接受过预防接种的宝宝，可再注射一次百日咳疫苗，以促使产生抗体，加强其免疫力。