手足口病发病初期，孩子会先有发热、咳嗽流涕和流口水等像上呼吸道感染一样的症状。有的孩子可能有恶心、呕吐等症状，以后手、足的指及趾背部出现椭圆形或梭形的水泡，疱的周围有红晕水疱的液体清亮，水疱的长轴与皮纹是一致的。

然后水疱的中心凹陷变黄、干燥、脱掉（脱屑），另外指、趾端有散在的比较坚硬的淡红色丘疹或者疱疹。

同时在口腔里，如嘴唇、舌口腔粘膜、齿龈上也有散在的水疱，但口腔里的水疱很快破溃而形成灰白色的小点或灰白色的一层膜其周围有红晕，在灰白色的膜下可以见到点状或片状的糜烂面。