当付款金额超过500，系统提示不能用花呗付款时，可能是以下原因造成的。比如说当前花呗可用额度不足500，或者说当前的交易环境存在风控，系统禁止使用花呗进行交易。常规的情况下，花呗可用额度大于500，一次性付款500是没有问题的。

因此，当用户花呗可用金额大于500，而不能对金额500的消费进行付款，请及时联系支付宝在线客服咨询。