圣彼得堡是温带海洋性气候

夏季温和，最热月7月平均气温17.7℃。冬季寒冷，冬季平均气温零下6.5℃，最冷月1月平均气温零下8℃，积雪期持续132天，结冰期从11月中旬至来年4月中、下旬。

圣彼得堡位于俄罗斯西北部，是芬兰湾的最内处，面积1439平方公里，南北长44公里，东西宽25公里，其中市区面积606平方公里。为大涅瓦河和小涅瓦河汇聚的三角洲地带。在18世纪初，这里还是一片沼泽。随着圣彼得堡市的建造，人工运河在市内纵横交错，这些运河是在叶卡捷琳娜二世时期开凿，以舒缓因芬兰湾水浅而倒灌进入圣彼得堡的海水。圣彼得堡共有42个小岛，由423座桥梁连接。