山东农业大学南校区专业主要有：农学、植物科学与技术、种子科学与工程、中药资源与开发、园艺、茶学、设施农业科学与工程、农业机械化及其自动化、交通运输、电气工程及其自动化、自动化、机械电子工程、车辆工程、动物科学、动物医学、水产养殖、制药工程（兽药方向）、应用化学、材料化学、生物技术、生物工程等。

材料补充：

山东农业大学南校区开设的院系：农学院、园艺科学与工程学院、食品科学与工程学院、植物保护学院、林学院、机械与电子工程学院、资源与环境学院、动物科技学院（动物医学院）、经济管理学院（商学院）、信息科学与工程学院、化学与材料科学学院、生命科学学院、公共管理学院、外国语学院、水利土木工程学院、国际交流学院、艺术学院、体育学院。