规模不一样。淘宝商城是厂家的大规模的；淘宝店铺是个人的小规模的。

开店条件不一样。淘宝开店毫无条件要求实名认证即可；淘宝商城开店是要交给淘宝网站一定费用的，所以作为主推品牌大力推广。

卖家身份不一样。淘宝卖家良莠不齐有大有小，而淘宝商城相对稳定。

安全性不一样。一些品牌与淘宝合作，就在淘宝商城以更加正规的形式出售正品。作为买家而言，相比较起来淘宝商城更有保证、更规范。