743年，世界上突然出现了人类的天敌“巨人”。在危机下残存下来的人类修筑了三重巨大的城墙。人们在这隔绝的环境里享受了一百多年的和平，直到艾伦·耶格尔十岁那年，60米高的“超大型巨人”突然出现，以压倒性的力量破坏城门，其后瞬间消失，凶残的巨人们成群的冲进墙内。

艾伦亲眼看着巨人在城里大肆破坏，他的家人也在这次灾难中去世。怀着对巨人的憎恨，城墙崩坏的两年后，艾伦加入104期训练兵团学习和巨人战斗的技术。在训练兵团的三年，艾伦在同期训练兵里有着其他人无法比拟的强悍精神力。即使亲眼见过地狱也依然勇敢地向巨人挑战的艾伦，如愿以偿加入了向往已久的调查兵团。就在他梦想守护人类的家园时，毁坏墙壁的超大巨人再一次出现了。