1、十七年前，美国堪萨斯州斯穆尔镇有流星划裂天际从天而降，这段历史留给镇民无限创伤和秘密。从火烧灰烬中现身的克拉克，从少年到成年经历无数困境，逼使他不得不藉由超能力对抗不同形式的黑暗势力，也让这个小镇从流星雨降临的那天起，发生许多难以解释的现象。

2、第五季结束时，萨德侵占雷克斯的身体，并灌输他跟克拉克一样的超能力，还释放一种病毒到地球。雷克斯告诉兰娜他的新力量，二人的关系因而更紧密。克拉克明白制止萨德的唯一方法就是用佐劳尔留下的水晶匕首杀了雷克斯。然而他却下不了手。在犹豫不决之际，不慎开启直达萨德的通道，引来毁灭性的爆炸，把克拉克送到幽灵特区，由雷克斯和萨德留在现实空间里统治全世界。

3、克拉克必须想尽办法离开幽灵区，不幸的是失去所有超能力的他，在狱中遇到一群因克拉克父亲而入狱的囚犯。在千钧一发之时，克拉克父亲的前助理雷雅协助克拉克越狱。

4、因克拉克背叛而转投雷克斯怀抱的兰娜，对雷克斯渐渐产生好感，更加深克拉克和雷克斯之间的嫌隙。雷克斯深爱兰娜，心中的恶魔却随时间成长，为了拥有兰娜，雷克斯不得不隐瞒一些事实。

5、克拉克和雷克斯因为种种事故，再加上克拉克试图阻止雷克斯的危险行径，雷克斯却毫不领情，造成两人不仅做不成朋友，还变成敌人。

6、而在地球的另一端产生一位新的亿万富翁奥利佛。他没有超能力，不过却是位参加过奥运射击比赛的天生神射手。他凭借天赋劫富济贫，行侠仗义。奥利佛来自星城，他的目的是化解释放到地球的病毒。一天奥利佛与露意丝巧遇，奥利佛对她产生仰慕之情，同时发现克拉克有超能力，于是他希望克拉克能够加入他筹组的一个新组织──超级英雄同盟。

7、已连续制播五季的「超人首部曲」，赋予了超人神话典型人物新生命及新意义。第六季除了延续前五季的悬疑迷炫气氛外，还将带领所有超人迷共享一段穿越时空的惊险过程。超人漫画书中克拉克和雷克斯誓不两立的对立，一向最为书迷津津乐道，也将在第六季中完整呈现。