共有以下6所高校：

1、济宁医学院，前身是创建于1952年的山东省济宁医士学校，1958年改为济宁医学院，招收第一届本科生，1987年1月，经原国家教育委员会批准，更名为济宁医学院。

2、曲阜师范大学，1981年山东省人民政府确立为重点建设的六所高校、全国首批招收研究生的高校之一，入选山东特色名校工程、惠普国际软件人才及产业基地项目共建高校。

3、济宁学院，是国家教育部批准设立的一所全日制普通本科高等院校。学校前身为济宁师范专科学校。

4、曲阜远东职业技术学院，成立于1998年，是由山东省人民政府批准、国家教育部备案成立的全日制普通高等职业学院。

5、济宁职业技术学院，2000年10月经山东省人民政府批准成立的全日制国办普通高等职业院校。

6、山东理工职业学院，学校始建于1950年，前身是山东省贸易职工大学，2009年3月经省政府批准改制为山东理工职业学院。