转录因子的定义及其作用方式本文简介:转录因子是一种具有特殊结构、行使调控基因表达功能的蛋白质分子,也称为反式作用因子。植物中的转录因子分为二种,一种是非特异性转录因子,它们非选择性地调控基因的转录表达,如大麦(Hordeumvulgare)中的HvCBF2(C-repeat/DREbindingfactor2)(Xueetal.,20
转录因子的定义及其作用方式本文内容:
转录因子是一种具有特殊结构、行使调控基因表达功能的蛋白质分子,也称为反式作用因子。植物中的转录因子分为二种,一种是非特异性转录因子,它们非选择性地调控基因的转录表达,如大麦
(Hordeum
vulgare)
中的HvCBF2
(C-repeat/DRE
binding
factor
2)
(Xue
et
al.,2003)。还有一种称为特异型转录因子,它们能够选择性调控某种或某些基因的转录表达。典型的转录因子含有DNA结合区
(DNA-binding
domain)、转录调控区
(activation
domain)、寡聚化位点(oligomerization
site)
以及核定位信号
(nuclear
localization
signal)
等功能区域。这些功能区域决定转录因子的功能和特性
(Liu
et
al.,1999)。DNA结合区带共性的结构主要有:1)HTH
和
HLH
结构:由两段α-螺旋夹一段β-折叠构成,α-螺旋与β-折叠之间通过β-转角或成环连接,即螺旋-转角-螺旋结构和螺旋-环-螺旋结构。2)锌指结构:
多见于
TFIII
A
和类固醇激素受体中,由一段富含半胱氨酸的多肽链构成。每四个半光氨酸残基或组氨酸残基螯合一分子
Zn2+
,其余约
12-13
个残基则呈指样突出,刚好能嵌入
DNA
双螺旋的大沟中而与之相结合。3)亮氨酸拉链结构:多见于真核生物
DNA
结合蛋白的
C
端,与癌基因表达调控有关。由两段α
-
螺旋平行排列构成,其α
-
螺旋中存在每隔
7
个残基规律性排列的亮氨酸残基,亮氨酸侧链交替排列而呈拉链状,两条肽链呈钳状与
DNA
相结合。
同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。转录调控区包括转录激活区
(transcription
activation
domain)
和转录抑制区
(transcription
repression
domain)
二种。近年来,转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-100个氨基酸残基,有时一个转录因子包含不止一个转录激活区。如控制植物储藏蛋白基因表达的VP1和PvALF转录因子,它们的N-末端酸性氨基酸保守序列都具有转录激活能力,与酵母转录因子GCN4和病毒转录因子的VP16的酸性氨基酸转录激活区有较高同源性
(Bobb
et
al.,1996)。典型的植物转录因子激活区一般富含酸性氨基酸、脯氨酸或谷氨酰胺等,如GBF
(G-box
binding
factor)
含有的GCB盒
(GBF
conserved
box)
激活结构域
(lunwen114
and
Bevan,1998)。
转录抑制区也是转录因子调控表达的重要位点,但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种:1)与启动子的调控位点结合,阻止其它转录因子的结合;2)作用于其它转录因子,抑制其它因子的作用;3)通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。
转录因子必须在核内作用,才能起到调控表达的目的。因此,转录因子上的核定位序列是其重要的组成部分。一般一个或多个核定位序列在转录因子中不规则分布,同时也存在不含核定位序列的转录因子,它们通过结合到其它转录因子上进入细胞核。核定位序列一般是转录因子中富含精氨酸和赖氨酸残基的区段。目前,水稻中的GT-2、西红柿中的HSFA1-2、玉米的O2和碗豆的PS-IAA4和6等转录因子中的核定位序列都已被鉴定
(Boulikas,1994;
Dehesh
et
al.,1995;
Lyck
et
al.,1997;
Varagona
et
al.,1992;
Abel
and
Theologis,1995)。
绝大多数转录因子结合
DNA前需通过蛋白质-蛋白质相互作用形成二聚体或多聚体。所谓二聚体化就是指两分子单体通过一定的结构域结合成二聚体,它是转录因子结合DNA时最常见的形式。由同种分子形成的二聚体称同二聚体,异种分子间形成的二聚体称异二聚体。这种多聚体的形成是转录因子上的寡聚化位点
(oligomerization
site)
相互作用的结果,寡聚化位点的氨基酸序列很保守,大多与DNA结合区相连并形成一定的空间构象。除二聚化或多聚化反应,还有一些调节蛋白不能直接结合DNA,而是通过蛋白质-蛋白质相互作用间接结合DNA,调节基因转录,这样就形成了一个表达调控的复合物。
转录因子的作用是通过和顺式因子的互作来实现的。这段序列可以和转录因子的DNA结合域实现共价结合,从而对基因的表达起抑制或增强的作用
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