哈尔滨工业大学的优势专业有:力学、机械工程、仪器科学与技术、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、控制科学与工程、计算机科学与技术、土木工程、管理科学与工程等。

在教育部第三轮学科评估中，哈尔滨工业大学有10个一级学科排名位居全国前五位，其中力学学科排名全国第一。材料科学、工程学、物理学、化学、计算机科学、环境与生态学、数学、生物学与生物化学等8个学科进入ESI全球前百分之一的研究机构行列，其中材料科学、工程学已进入全球前千分之一的研究机构行列。