按照五大战区区域划分，属于西部战区管辖，按照省级军区划分，属于新疆军区。但是以上只是地域划分，实际上新疆生产建设兵团是一个省部级的行政机构，而不是部队。沿用的名称是部队的，包括各级机构及领导名称也是部队的，就是人，全是地方人员。
兵团土地面积7.06万平方千米，占新疆总面积的4.24%，约占全国农垦总面积的五分之一。兵团承担着国家赋予的屯垦戍边职责，实行党政军企合一体制，是在自己所辖垦区内，依照国家和新疆维吾尔自治区的法律、法规，自行管理内部行政、司法事务受中央政府和新疆维吾尔自治区双重领导，是国务院计划单列的省（部）级单位，享有省级的权限。
截止2019年底，兵团拥有256万人口，下辖14个农业师，4634个企事业单位，控股11个上市公司，成为新疆经济发展的三大支柱之一。在工业方面，兵团拥有了煤炭、电力、纺织、轻工、食品、造纸、皮革、机械、化工、建材、医药等工业体系，生产总值达144亿元。在农业方面，兵团拥有745.56万公顷土地，其中耕地103.72万公顷，人均棉花、油料产量居全国第一。
1949年新疆和平解放后，为发展西部经济及保卫边疆，中央决定于1954年正式成立新疆生产建设兵团。部队的10.5万名官兵连同6万余名家属，于1954年8月集体就地转业，脱离国防部队序列，组建新疆军区生产建设兵团，后称新疆生产建设兵团。所以沿用的名称和机构称呼等全是部队的，兵团司令员政委相当于省长省委书记，农业师师长政委就是地级市市长书记，农垦团团长政委就是县长县委书记。