1、卫校的院系和研究所大致可以分为临床医学和基础医学。临床医学包括医务科、药剂科、护理科、医技科，以培养医生、药师、护士、医学检验师、康复技师等与维护人类生命安全直接相关的专业人员。有时候大学里的药学系会独立成为药学院。

2、基础医学部分主要是培养医学领域的研究型人才，主要研究方向有解剖学、病理学、微生物学、分子生物学、生物化学、药理学、法医学、放射医学等。医学院的院长通常是有行医资格的教授。