摩托车风冷和水冷的区别是：1、散热方式不同：风冷的散热方式是通过车辆行驶带来的风进行冷却；水冷的散热方式是通过流动的水包裹缸套和缸头来降温。2、配置不同：风冷的缸筒会设计较大的散热片，缸头会设计散热片以及风道；水冷的基本配件是水泵、水箱温控、风扇。摩托车风冷的特点是：散热系统零故障自然冷却，占用空间少。摩托车水冷的特点是：对高功率高转速的发动机进行有效地温度控制，水冷车在温度低的时候节流阀会关闭直到机油温度升高以达到润滑效果。