全真教有三大祖庭。

1、山西永乐宫位于山西芮城县城北约三公里处的龙泉村东，全真三大祖庭之一，建于元代。永乐宫因是吕洞宾和王重阳的修炼地，所以被全真道视为祖庭之一。

2、陕西重阳宫又称为重阳万寿宫、祖庵，享有“天下祖庭”、“全真圣地”之盛名。位于陕西省西安市户县祖庵镇，距离西安市中心西南40公里。重阳宫为全真派的三大祖庭之一，是全真道祖师王重阳早年修道和遗蜕之所。

3、北京白云观位于北京西便门外。丘处机赴雪山应成吉思汗聘，回京后居太极宫，元太祖因其道号长春子，诏改太极宫为长春宫。及丘处机羽化，弟子尹志平等在长春宫东侧营建下院，即今白云观，并于观中构筑处顺堂，安厝丘处遗蜕。