父亲邓以蛰当时是北京医科大学、北京大学、清华大学等校哲学系教授，与杨振宁父亲杨武之是多年之交。

母亲王淑蠲，操持家务。

邓以蛰四个子女，邓稼先排行第三，邓稼先出生8个月以后，随母亲和两个姐姐来到北平（即北京）；1936年，考入北平崇德中学初中二年级，读至高一（因抗日战争，崇德中学在1939年停办）。这三年，他在英文、数学、物理方面打下了良好的基础。在崇德中学，与高他两班的杨振宁成为好友。