sd序列的特点是在起始密码子上游约4～7个核苷酸之前还有一段富含嘌呤的5′…AGGAGG…3′短小序列，它可以与16SrRNA3′端的3′…UCCUCC…5′区段完全互补。mRNA上的这段序列称为ShineDalgarno序列（简称SD序列）。

SD序列的作用是与16SrRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列结合，小亚基16SrRNA的3'端的这个小片段就被称为反SD序列。当mRNA中的SD序列于16SrRNA上的反SD序列结合后，就指示了下游的AUG，即是蛋白质合成的起始密码子。