汽车脚垫底下会有水的原因：车厢底部排水塞漏水、天窗排水管漏水、车门漏水、暖风水箱漏防冻液、空调排水管破损或未安装好。还有多种可能性：1、天窗漏水、密封不严，需要检查天窗；2、洗车冲进去的水没有清理干净；3、车的小水箱也就是车内暖风用的锈蚀、漏水。如果后座脚垫下面的积水很多，就需要拆下车上的座椅，脚垫、地毯和车底海绵，清理车上的积水后将损坏的控制单元进行更换并且检查一下有没有进水的线路，以免后续发生短路。