微信提现1000元扣多少手续费，要分三种情况来说明：

1、有免费额度1000元，这时候提现1000元是免手续费的。

2、免费提现额度1000元用了一部分，但微信累计提现额度没有达到1000元。这时候提现，额度在1000元免费额度之内的，免手续费。超过1000元的部分，按照0.1%收手续费。

3、免费提现额度1000元已经用完，那么提现1000元要扣1000*0.1%=1元手续费。