福田保税区的功能定位是“保税仓储、出口加工、转口贸易”三大功能。保税区是由海关设置的或者经过海关批准注册、受海关监督和管理的可以较长时间存储商品的区域。保税区能方便转口贸易，能增加有关费用的收入。运入保税区的货物可以进行储存、改装、分类、混合、展览以及加工制造，但必须是在海关监管范围内。

外国商品存入保税区是不需要缴纳进口关税的，可以自由出口，只需交纳少量的费用，但如果要进入关境的话是需要交纳关税的。