火车站有两个，一个在市区。一个在沙县，目前动车只到三明北站。

三明火车站位于福建省三明市三元区工业南路117号，鹰厦铁路的中部的一个车站，隶属南昌铁路局永安车务段管辖，现为一等站。站场设有两座站台，均有防雨设施，一号与二号站台有地道相连，是三明市重要窗口单位之一，始建于1956年。

三明北站位于福建省三明市沙县，按照国家一级站场标准设计，设计规模为5台16线，汇聚向莆[2]、南三龙、鹰厦、南厦四线，最高聚集人数为5000人，站房建筑总面积约20000平方米。站房设计方案构思取意“闽中印象，文明新城”，汲取闽中文化、民居内涵，是三明综合交通枢纽的重要组成部分。